Egyes munkáltatók kínálnak türelmi idő lehetőséget munkavállalóik rugalmas kiadási számlájára vagy az FSA-ra. A türelmi idő alkalmazandó az egészségügyi FSA-ra és az eltartott gondozási FSA-ra. A tervév végét követő napon kezdődik, és két és fél hónapig tart. Úgy tervezték, hogy lehetővé tegyék a munkavállalók számára, hogy teljes mértékben kihasználják a nem adóköteles hozzájárulásaikat, amikor a költségek elmaradnak az eredetileg tervezettől.
Az ezen türelmi idő alatt felhalmozódott támogatható egészségügyi költségek az előző tervévtől az FSA-ban fennmaradó pénzeszközökkel téríthetők meg. A türelmi idő bevonása a terv évét 14 hónapra és 15 napra meghosszabbítja, szemben a 12 hónapos tényleges tervvel. A naptári évre vonatkozó tervek esetében a türelmi idő január 1-jén kezdődik és március 15-ig ér véget. A türelmi idő végén a számlán fennmaradó pénzeszközök elvesznek a „használd el vagy veszed el” szabály szerint, amely előírja az FSA-ban fennmaradó pénzeszközök, amelyeket a tervév végén el kell veszíteni. A türelmi idő alatt benyújtott igényeket automatikusan levonják az előző évi fennmaradó pénzeszközökből, mielőtt a folyó tervévből levonnák; azonban abban az esetben, ha betéti kártyát használnak elszámolható költségekre, akkor a pénzeszközöket a folyó tervévből veszik fel.
Képzelje el például, hogy a tervezési év 2013. december 31-én ér véget. Ezen a ponton még mindig 150 dollár van hátra a FSA-ban fel nem használt pénzeszközökből. 2014. február 5-én 400 USD elszámolható támogatható egészségügyi költségekkel jár. A követelés benyújtását követően a 2013. évi tervből fennmaradó 150 dollárt először felhasználják visszatérítésre, a többi 250 dollárt pedig a 2014-es terv forrásaiból veszik igénybe.
A munkaadók nyújthatnak türelmi időt vagy átviteli rendelkezéseket, de nem mindkettőt. Az átviteli rendelkezés lehetővé teszi, hogy legfeljebb 500 USD-t vihessen át a következő tervévre, anélkül, hogy felhasználná azt. Ugyanakkor mind a türelmi idő, mind az átváltási lehetőség mellett továbbra is fennáll a maximális 2500 dolláros éves hozzájárulás korlátja. A türelmi időszak opciójának kihasználása érdekében az FSA terveit módosítani kell az opciónak az előző év végéig történő bevonása érdekében. Ha a 2015-ös évre türelmi periódust választana, a munkáltatónak 2014. december 31-ig módosítania kell a tervet egy naptári évre vonatkozó terv készítéséhez. A terveket az év közepén nem lehet megváltoztatni, hogy belefoglalják a türelmi időt.
Fontos emlékezni, hogy a következő év március 15-ig elszámolható költségeket kell viselnie, de a visszatérítés iránti kérelmeket március 31-ig lehet benyújtani. Ezt a 16 napos időszakot kifogyási időszaknak nevezik. A kifutási időszak lejártát követően minden fel nem használt pénzeszközt elvesznek.
